返信が遅くなり、大変申し訳ありません。
「ご注文内容の確認」で注文が空になる場合があるというのは、こちらでは確認できていませんが、何度も空になることがあるのでしょうか？

確認メールは、管理者のメールアドレスで送信されますが、メールを受信するソフトによって迷惑メールに分類されることがあります。
迷惑メールフォルダに入っているということはないでしょうか？

管理者のメールアドレスを、gmailなどに変えると届くようになるかもしれません。
よろしくお願いいたします。